Perbesaran mikroskop biologis biasanya rendah, berkisar antara 40x hingga 1000x. Hal ini karena sampel biologis biasanya transparan dan memerlukan perbesaran sedang untuk mengamati struktur sel dan jaringan.
Dalam mikroskop biologis, perbesaran ditentukan oleh kombinasi lensa objektif dan lensa okuler. Perbesaran lensa objektif yang umum meliputi 4x, 10x, 40x, dan 100x, sedangkan lensa okuler biasanya memiliki perbesaran 10x. Oleh karena itu, perbesaran maksimum mikroskop biologis pada umumnya adalah 100x objektif dikalikan 10x lensa okuler, yaitu 1000x.
Penting untuk dicatat bahwa perbesaran mikroskop biologis tidak setinggi mikroskop elektron karena sampel biologis seringkali memiliki struktur yang kompleks, dan proses observasi memerlukan pemeliharaan viabilitas dan integritas spesimen. Selain itu, resolusi mikroskop biologis juga penting karena struktur biologis seringkali sangat kecil dan memerlukan resolusi tinggi untuk mengamati detail yang halus.
Dalam aplikasi khusus tertentu yang memerlukan pembesaran lebih tinggi, seperti penelitian patologis atau bedah mikro, lensa mata dengan pembesaran lebih tinggi (misalnya, 16x atau lebih tinggi) dapat digunakan dalam kombinasi dengan lensa mata yang sesuai untuk mencapai pembesaran yang lebih tinggi. Namun, pengamatan dengan perbesaran tinggi ini biasanya memerlukan persiapan sampel dan teknik mikroskop yang lebih kompleks serta menuntut keterampilan yang lebih besar dari operator.